基于GEO数据库对颅内动脉瘤形成与破裂相关基因的挖掘与分析

摘要：

目的 :基于GEO数据库挖掘与颅内动脉瘤(IA)形成和破裂相关的潜在基因.方法 :从GEO数据库中收集IA人群研究的mRNA基因芯片共计133例.在GEO2R平台内对各组的数据做差异mR-NA基因分析,筛选出共同差异基因并完成基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.将筛选出的差异基因导入String在线数据库,获得差异基因所编码的蛋白质之间的相互作用.结果 :筛选出共同差异基因42个,主要参与的生物学过程包括RNA聚合酶 Ⅱ 启动子对氧化应激反应的转录调控 、趋化因子产生的正向调节 、巨细胞自噬的阳性调节;主要发挥的分子功能包括蛋白质结合 、RNA聚合酶 Ⅱ 转录辅阻遏活性 、转录激活因子活性和蛋白激酶C结合;在细胞组分方面不呈现富集状态.主要覆盖的信号通路包括缺氧诱导因子-1信号通路 、胰高血糖素信号通路和代谢途径信号通路.结论 :初步筛选出IA的形成与破裂可能与偕胺肟还原组件1、肿瘤坏死因子-α 诱导蛋白6、结合珠蛋白 、肥大细胞膜表达蛋白1、ZAK、磷脂酶Cβ4以及血液和神经系统表达因子1等蛋白所介导的生物学功能过程相关,除了既往已知的IA机制外,细胞自噬和HIF-1通路可能也参与了IA的形成.

关键词：颅内动脉瘤、数据挖掘、基因

所属期刊栏目：25

分类号：R743;TP311.13(神经病学与精神病学)

资助基金：国家自然科学基金31200809;上海市虹口区卫计委项目虹卫1802-06;同济大学"中央高校基本科研业务费专项资金"项目22120180282

在线出版日期：2019-09-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1281-1286