基于TCGA数据库的肾透明细胞癌基因表达及预后因素分析

摘要：

目的 分析肾透明细胞癌(ccRCC)基因表达变化及预后相关因素.方法 运用R/Bioconductor分析平台,基于肿瘤基因组图谱计划(TCGA)中的ccRCC研究数据,运用Limma算法筛选肿瘤组与对照组间倍数改变>2,P<0.05的基因为差异表达基因.进一步以患者年龄、性别、TNM分期、基因表达值为影响因素分析并绘制Kaplan-Meier生存曲线.结果 在肿瘤组织中筛选出4837个差异表达基因(上调基因1974个,下调基因2863个),其中252个差异基因倍数改变>5个(27个上调基因,225个下调基因);性别因素对患者整体生存率无显著影响(P>0.05);随着年龄增加以及TNM分期的进展,患者整体生存率下降(P<0.05);随着基因NPTX2、HSF4表达升高,患者整体生存率下降(P<0.05);随着基因TMEM213表达升高,患者整体生存率上升(P<0.05).结论 本研究鉴定了肾透明细胞癌的基因表达变化及预后相关因素,能够为疾病的分子诊断与预后评估等提供依据.

关键词：肾透明细胞癌、肿瘤基因组图谱计划、差异表达基因、生存曲线、分子诊断、预后评估

所属期刊栏目：31

分类号：R737.11(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金编号:81702067

在线出版日期：2020-08-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：1778-1781