识别糖酵解相关LncRNA对头颈鳞状细胞癌的预后价值

摘要：

目的 探究糖酵解相关的长链非编码RNA(lncRNA)在头颈鳞状细胞癌(SCCHN)发生、发展中的作用.方法 在TCGA数据库和MSigDB数据库中,获取SCCHN患者的正常组织和癌组织的RNA测序信息和糖酵解基因,通过"limma"包筛选出差异的lncRNA和糖酵解基因,并对差异糖酵解基因进行GO和KEGG功能富集分析;通过Pearson相关分析并筛选出lncRNA后,通过单因素和多因素Cox回归分析构建基于lncRNA表达的风险模型;绘制Kaplan-Meier生存曲线、ROC曲线及决策曲线,通过ESTIMATE估计免疫和基质评分确定SC-CHN高/低风险组在信号通路、免疫微环境、免疫检查点、m6A相关基因方面的差异.结果 总共筛选出298个GRLs,通过单因素Cox回归分析确定了60个具有显著预后价值的GRLs,并成功构建了GRLs的风险模型,ROC曲线证明了模型的准确性;相较于高风险组,低风险组免疫细胞浸润增加,并且m6 A调节因子和免疫检查点表达均升高.结论 基于GRLs的预后指标是SCCHN患者预后的独立风险因素,是潜在的生物标志物和治疗靶点.

关键词：头颈鳞状细胞癌、糖酵解、lncRNA、风险模型、免疫学

所属期刊栏目：47

分类号：R34(人体生物化学、分子生物学)

资助基金：贵州省科技计划项目2021

在线出版日期：2022-05-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：426-432,438