10.11675/j.issn.0253-4304.2023.11.12
基于网络药理学和分子对接技术探讨贞芪扶正颗粒辅助治疗肺结核的作用机制
目的 基于网络药理学和分子对接技术探讨贞芪扶正颗粒辅助治疗肺结核的作用机制.方法 利用中药系统药理学数据库与分析平台检索贞芪扶正颗粒的活性化学成分及其作用靶点,利用GeneCards? 数据库检索肺结核相关靶点,取两者交集靶点.采用Cytoscape 3.7.2 软件构建"中药-成分-靶点"网络以获取主要活性化学成分.采用STRING数据库及Cytoscape 3.7.2 软件构建交集靶点的蛋白-蛋白相互作用网络,筛选核心靶点.对核心靶点进行基因本体论(GO)功能富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.使用AutoDock软件对主要活性化学成分和核心靶点进行分子对接.结果 共得到贞芪扶正颗粒的活性化学成分31 个及其作用靶点198 个,肺结核相关靶点2 415 个,交集靶点101 个.主要活性化学成分包括槲皮素、木犀草素、山柰酚、β-谷甾醇、芒柄花素;核心靶点包括白细胞介素(IL)-6、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1、IL-1β、肿瘤蛋白p53、基质金属蛋白酶9(MMP9)、Caspase-3、原癌基因c-Jun、C-X-C基序趋化因子配体8(CXCL8)、前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、过氧化物酶体增生激活受体γ(PPARG).GO功能富集分析结果显示,核心靶点涉及的生物学过程主要有机械刺激反应、生物调节、代谢过程等,涉及的细胞组分主要有细胞膜、细胞核、膜封闭管腔等,涉及的分子功能主要包括蛋白质结合、核苷酸结合、离子结合等.KEGG通路富集分析结果显示,核心靶点涉及的信号通路主要包括IL-17 信号通路、肿瘤坏死因子信号通路等.分子对接结果显示,MMP9、IL-6、PTGS2、PPARG、CXCL8 与贞芪扶正颗粒的主要活性化学成分均有稳定的对接效果(结合能<-5.0 kcal/mol).结论 贞芪扶正颗粒辅助治疗肺结核的作用机制具有多成分、多靶点和多通路的特点,其活性化学成分槲皮素、木犀草素等可能通过作用于MMP9、IL-6、PTGS2、PPARG、CXCL8 等靶点,来抑制IL-7 信号通路、肿瘤坏死因子信号通路,从而发挥辅助治疗肺结核的作用.
肺结核、贞芪扶正颗粒、网络药理学、分子对接、作用机制
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R521;R285(结核病)
2023-08-22(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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