加味苏连温胆汤治疗终末期肾病作用机制的生物信息学研究

摘要：

目的 基于生物信息学探讨加味苏连温胆汤治疗终末期肾病(ESRD)的作用机制.方法 利用中药系统药理学数据库及分析平台检索加味苏连温胆汤5味中药的活性成分及其潜在作用靶点.通过GEO数据库检索与ESRD有关的芯片(GSE37171),利用R语言软件筛选出ESRD组织与正常肾脏组织的差异基因(简称ESRD差异基因).对加味苏连温胆汤活性成分的潜在作用靶点与ESRD差异基因取交集,得到加味苏连温胆汤治疗ESRD的作用靶点.通过CytoScape 3.7.0软件绘制加味苏连温胆汤治疗ESRD的作用靶点的蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,并构建拓扑网络找寻核心作用靶点.利用R语言软件对加味苏连温胆汤治疗ESRD的作用靶点进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析.结果 共获得加味苏连温胆汤有效活性成分潜在作用靶点457个及ESRD差异基因422个,取交集后得到10个交集基因(EP300、FOS、HIF-1α等).构建PPI网络后通过设置相关参数,得到EP300、BRCA1、TP53、ESR1、HSP90 AA1、CUL3、NTRK1为主要基因的拓扑网络,其中核心作用靶点为EP300.GO功能富集分析结果显示,加味苏连温胆汤治疗ESRD的作用靶点共涉及399种生物过程、10种分子功能、1种细胞组分,其中生物过程包括细胞对氧化应激的反应等,分子功能包括Tau蛋白连接等,细胞组分为转录因子复合物.KEGG富集分析结果显示,加味苏连温胆汤治疗ESRD的作用靶点涉及脂肪酸降解及缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸降解两条信号通路.结论 加味苏连温胆汤中的多种活性成分可能通过与EP300、FOS、HIF-1α 等基因相互作用,调控细胞对氧化应激的反应等生物过程,转录因子复合物等细胞组分,Tau蛋白连接等分子功能,进而单独或者共同调控脂肪酸降解通路及缬氨酸、亮氨酸和异亮氨酸降解等信号通路来发挥治疗ESRD的作用.

关键词：终末期肾病、加味苏连温胆汤、作用机制、生物信息学

所属期刊栏目：44

分类号：R692;R285(泌尿科学（泌尿生殖系疾病）)

资助基金：国家自然科学基金;中国中医科学院基本科研业务费自主选题资助项目;北京市科技计划课题

在线出版日期：2022-11-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：2010-2016