缺氧相关长链非编码RNA与乳腺癌患者预后的相关性及其在预测乳腺癌预后的风险中的价值

摘要：

目的 探讨缺氧相关长链非编码RNA(lncRNA)与乳腺癌患者预后的相关性及其在预测乳腺癌预后的风险中的价值.方法(1)从癌症基因组图谱数据库中获得981例乳腺癌患者的RNA转录组测序数据和临床数据.采用Spearman检验筛选与缺氧相关的lncRNA.依次采用批量单因素Cox回归、LASSO回归、多因素Cox回归模型筛选和确定影响乳腺癌患者生存情况的缺氧相关lncRNA,并根据相关系数建立风险评分模型.(2)根据风险评分(中位值为1.27分)将乳腺癌患者分为高危组和低危组,比较两组患者的生存情况;并采用时间依赖性受试者工作特征(ROC)曲线评估风险评分预测乳腺癌患者预后的效能.(3)以风险评分和年龄及肿瘤分级、原发肿瘤-区域淋巴结-远处转移(TNM)分期等临床病理特征为自变量,采用单因素和多因素Cox回归模型分析乳腺癌患者预后的独立影响因素;利用获得的独立影响因素构建预测乳腺癌患者1年、3年、5年生存情况的Nomogram模型;应用ROC曲线评价并比较Nomogram模型与年龄及肿瘤分级、TNM分期等临床病理指标预测乳腺癌患者生存情况的效能.结果(1)12个缺氧相关lncRNA(TNFRSF14-AS1、AL606834.2、LINC01871、AL136368.1、SEMA3B-AS1、AL136531.1、BAIAP2-DT、AC061992.1和AC008105.3、Z68871.1、LINC01235和AC090198.1)与乳腺癌患者的预后密切相关.(2)高危组乳腺癌患者生存时间短于低危组(P<0.05).风险评分对乳腺癌患者预后的预测准确度较好(一致性指数为0.798),其预测乳腺癌患者1年、3年和5年生存情况的效能较好(曲线下面积分别为0.699、0.755、0.729,均P<0.05).(3)年龄和风险评分是影响乳腺癌患者预后的独立危险因素(均P<0.05).基于年龄和风险评分的Nomogram模型预测乳腺癌患者生存情况的曲线下面积为0.750.结论 12个缺氧相关lncRNA与乳腺癌患者的生存情况密切相关,由其组成的风险评分模型对乳腺癌患者的预后具有较好的预测价值.

关键词：乳腺癌;缺氧;长链非编码RNA;癌症基因组图谱数据库;预后;预测

所属期刊栏目：43

分类号：R737.9(肿瘤学)

在线出版日期：2022-02-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：2678-2683