基于生物信息学分析免疫紊乱在类风湿关节炎发病机制中的作用

摘要：

目的 探讨免疫紊乱在类风湿关节炎(RA)发病机制中的作用.方法 在GEO数据库下载3个人类RA滑膜组织基因芯片数据.使用limma包筛选RA相关差异表达基因后,进行通路和功能富集分析,并通过权重基因共表达网络分析(WGCNA)法筛选关键模块.筛选RA差异表达基因中与免疫相关的差异表达基因及关键基因,针对3个RA数据集进行免疫细胞浸润分析,再采用Pearson相关分析关键基因与免疫细胞的相关性;在GEO数据库下载RA小鼠外周血单细胞测序数据,以验证关键基因在免疫细胞中的表达.结果 共筛选差异表达基因632个,其中上调的差异表达基因369个,下调的差异表达基因263个.WGCNA分析共获得4个模块,其中绿松石模块包含基因最多,同时与蓝色和棕色模块有较高的相关性,基因显著富集在趋化因子信号通路、细胞因子与细胞因子受体的相互作用、原发性免疫缺陷、T细胞受体信号传导途径、RA等通路.RA滑膜组织中细胞毒性T细胞、1型调节性T细胞、B淋巴细胞、CD8+T淋巴细胞、中央记忆型T细胞浸润比例增多;共筛选到234个免疫相关的差异表达基因,前5个最关键的B淋巴细胞免疫相关基因为CR2、PAX5、CCL19、UBASH3 A、TRAT1,表达量均与B淋巴细胞矩阵呈正相关(均P<0.05).验证结果显示,RA组和正常组B淋巴细胞中CR2、PAX5、UBASH3 A基因的表达量差异有统计学意义(均P<0.05).结论 免疫紊乱与RA发病机制密切相关,B淋巴细胞、CD8+T淋巴细胞以及CR2、PAX5、UBASH3A基因可能在RA的发生中发挥了关键作用.

关键词：类风湿关节炎;免疫;B淋巴细胞;T淋巴细胞;生物信息学

所属期刊栏目：43

分类号：R593.22(全身性疾病)

资助基金：广西南宁市科学研究;技术开发计划

在线出版日期：2021-09-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1612-1617,1630