基于psbA-trnH和rDNA ITS序列的不同地理居群巴戟天聚类分析

摘要：

[目的]基于psbA-trnH和rDNA ITS序列进行不同地理居群巴戟天聚类分析,探讨不同地理居群巴戟天遗传变异与地理分布之间的相关性,为其道地性研究提供理论参考.[方法]以13个来自广东、广西和福建的不同地理居群巴戟天为研究对象,采用改良CTAB法提取其新鲜叶片DNA,以其为模板分别扩增psbA-trnH和rDNA ITS序列.采用ClustalX 1.81进行多重对位排列,应用MEGA 6.06中K2P(Kimura 2-parameter)模型计算遗传距离,并运用邻近法构建系统发育进化树.[结果]不同地理居群巴戟天的psbA-trnH序列长度为306 bp,GC含量为27.2％,保守率83.33％,变异率16.67％,简约信息率26.14％;不同地理居群巴戟天的rDNA ITS序列长度为571 bp,GC含量为64.1％,保守率91.42％,变异率8.58％,简约信息率14.19％.不同地理居群巴戟天的psbA-trnH序列遗传距离为0～0.128,其中广东省的5个样品间遗传距离整体较小;福建省的4个样品与广西和广东的样品间遗传距离整体较大.不同地理居群巴戟天的rDNA ITS序列遗传距离为0～0.102,其中福建省的永定2号与其他样品遗传距离均较大.基于psbA-trnH和rDNA ITS序列构建的系统发育进化树均将广东省的5个巴戟天样品聚为一支,但rDNA ITS序列构建的系统发育进化树还将广西区的4个巴戟天样品聚为一支,说明其可较好地区分广东省和广西区不同地理居群的巴戟天.[结论]巴戟天遗传结构与地理分布存在一定的相关性,深入研究巴戟天遗传变异与地理分布间的相关性时应以rDNA ITS序列为主、psbA-trnH序列为辅.

关键词：巴戟天、居群、psbA-trnH、rDNAITS、系统发育进化树、聚类分析

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分类号：S567.239(经济作物)

资助基金：财政部中央本级专项项目2060302;山东省中医药科技发展计划项目2017-517;中国中医科学院重点领域中药资源保护与利用项目ZZ10-027

在线出版日期：2019-03-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：2364-2370