10.3969/j.issn.1674-7593.2023.05.004
染色体维持蛋白基因家族在头颈癌中的差异表达和预后价值
目的 探讨染色体维持蛋白(MCM)在头颈癌中的表达和预后治疗效果,旨在为头颈癌潜在的生物标志物以及治疗靶点提供更多的证据.方法 使用Oncomine、GEPIA和Human Protein Atlas在线数据库分析MCM在头颈癌中的表达差异;运用GeneMANIA和STRING在线平台预测并构建MCM蛋白质相互作用网络;通过Metascape数据库对MCM进行功能和通路富集分析;通过Kaplan-Meier plotter分析平台研究MCM在头颈癌中的预后价值;使用Timer在线工具完成MCM与头颈癌中的免疫浸润细胞的相关性研究.结果 头颈癌中MCM2/3/4/5/6/7/8/10的mRNA表达较正常头颈部组织显著增加(P<0.01),其中MCM2/3/7在转录和翻译阶段均过表达.MCM2-MCM7与DNA复制密切相关,并且发现细胞周期相关基因与MCM复合体密切相关.功能和通路富集分析表明其生物学功能主要与DNA复制和cGMP-PKG信号通路有关.MCM1/3/5/6/10的高表达与头颈癌患者总生存期的改善明显相关(P<0.05).此外,人类乳头瘤病毒(HPV)感染状态对MCM基因家族的表达会造成一定影响,头颈鳞癌HPV阳性(HNSCC-HPV-pos)中MCM的表达与免疫浸润的丰度显著相关,尤其是B细胞、CD8+T细胞和CD4+T细胞.HNSCC-HPV-pos亚组的B细胞、CD8+T细胞和中性粒细胞免疫浸润明显增加(P<0.05),这与MCM的表达水平有关.结论 MCM2/3/7的异常高表达提示其在头颈癌发生发展中起重要作用.MCM1/3/5/6/10可作为判断头颈癌患者生存率的候选预后标志物.
MCM基因家族、头颈癌、预后、生物标志物、生物信息学
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R735.2;S852.65;R319
河南省自然基金资助项目;河南省医学科技攻关计划省部共建重点项目
2023-10-13(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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528-538