人星状病毒临床分离株感染 CaCo-2细胞的转录组分析

摘要：

人星状病毒（human astrovirus ，HAstV）是引起婴幼儿病毒性腹泻的重要病原之一，但其致病机制及与宿主相互作用的数据非常有限。本研究旨在了解HAstV感染细胞后对宿主基因在转录水平上的影响。首先，利用临床分离 HAstV毒株感染 CaCo‐2细胞，用实时定量反转录‐聚合酶链反应（reverse transcriptase‐polymerase chain reaction ，RT‐PCR）检测细胞培养上清液中的病毒总RNA ，结果显示接种后9～24 h病毒总RNA拷贝数明显增加。然后，利用转录组测序全面比较感染与未感染 HAstV的CaCo‐2细胞转录本，筛选两者间的差异表达基因；并应用KEGG信号通路富集性方法分析差异表达基因相关的信号通路。结果显示，差异基因富集在两条信号通路上（P＜0．05），分别为轴突导向通路和Ras信号通路。本研究首次利用深度测序技术分析了HAstV感染对宿主基因在转录水平上的影响，为进一步研究HAstV致病机制等提供了方向。

关键词：人星状病毒、转录组测序、转录组

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分类号：R37;S85

资助基金：“十二五”国家科技重大专项2012ZX10004-211-03;上海市第四轮公共卫生三年行动计划重点学科建设15GWZK0101

在线出版日期：2016-06-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：79-86