权重基因共表达网络鉴定外周血脑卒中相关微RNA

摘要：

目的:通过分析脑卒中患者外周血微RNA(microRNA,miRNA)表达谱,探索miRNA潜在的诊断价值.方法:下载基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)中脑卒中患者和对照组的miRNA表达谱(GSE117064),使用R软件的"limma"包筛选出具有统计学差异的miRNAs;使用权重基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)识别与脑卒中相关的miRNA;使用Cytoscape软件分析并可视化权重网络;收集脑卒中患者和正常人的外周血miRNA,使用反转录聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)验证;最后,使用R软件的"pROC"包评估枢纽miRNAs诊断脑卒中的价值.结果:通过分析脑卒中患者外周血miRNA芯片数据集,共筛选出641个差异表达miRNAs;WGCNA识别并分析与脑卒中相关的miRNA模块,筛选出4个具有诊断价值的枢纽miRNAs(miR-1910-5p、miR-636、miR-7108-3p和miR-887-3p);RT-PCR证实miR-1910-5p、miR-636、miR-7108-3p和miR-887-3p在脑卒中患者外周血中表达降低;miR-1910-5p、miR-636、miR-7108-3p和miR-887-3p诊断脑卒中的曲线下面积(area under curve,AUC)依次为0.962、0.970、0.962和0.973;枢纽miRNAs联合诊断脑卒中的AUC为0.987.结论:脑卒中患者外周血异常表达的miRNA是潜在的诊断标志物,为探索脑卒中的发病机制和诊疗策略提供了线索.

关键词：脑卒中;微RNA;权重基因共表达网络分析;生物标志物

所属期刊栏目：41

分类号：R743.3;R394.2;R-058

在线出版日期：2022-01-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：2785-2792