原发性干燥综合征患者唾液腺中染色质调节因子相关基因的表达分析及其与免疫浸润的关系

摘要：

目的 分析染色质调节因子(CRs)相关基因在原发性干燥综合征(pSS)患者唾液腺中的表达情况,并探讨其与pSS患者唾液腺免疫浸润的相关性.方法 通过下载并整合基因表达综合数据库(GEO)的3个包含pSS患者和健康对照者唾液腺基因表达阵列的数据集,纳入38例pSS患者作为pSS组,32例健康对照者作为对照组,并对22189个基因的表达情况进行分析,包括筛选与CRs有关的差异表达基因(DEGs)、基因本体论(GO)富集分析.所有数据集都在R语言(4.0.3)中使用相关程序包进行分析,采用ssGSEA算法获得不同免疫细胞和免疫功能的免疫浸润评分,并对不同免疫细胞间和不同免疫功能间的免疫浸润评分进行相关性分析.对pSS组和对照组的免疫浸润评分进行差异分析.结果 从22189个基因中共筛选出850个与CRs有关的基因表达,差异分析共筛选出11个DEGs,其中包括10个上调基因和1个下调基因.GO富集分析提示,频率最高的4种生物学过程为正向调控DNA修复、调节DNA损伤刺激反应、非同源端连接修复双链DNA和DNA修复,所涉及的细胞组分包括性染色体、PML核体、染色体端粒和核心蛋白复合体.对免疫细胞的相关性分析提示,肿瘤浸润淋巴细胞(TIL)和B细胞的相关性最高(r=0.90,P<0.001),其次为滤泡辅助性T细胞(Tfh)和TIL(r=0.72,P<0.001);在免疫功能方面,免疫检查点和T细胞共刺激的相关性最高(r=0.92,P<0.001),其次为免疫检查点和CC趋化因子受体(r=0.89,P<0.001).pSS组9种免疫细胞和8种免疫功能的免疫浸润评分较对照组显著上调(P<0.05).结论 pSS患者唾液腺中DEGs数量较少,但是与受损唾液腺免疫浸润异常有关,值得临床医生的关注.

关键词：染色质调节因子、差异表达基因、原发性干燥综合征、免疫浸润

所属期刊栏目：44

分类号：R446.8(诊断学)

资助基金：西南医科大学教改项目;四川省医学会项目

在线出版日期：2023-02-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：301-305,310