10.3969/j.issn.1673-4130.2020.07.016
7种数据库工具对MRPL13蛋白在乳腺癌中的表达、功能分析及预后价值研究
目的 通过Oncomine、cBioPortal、癌症细胞系百科全书(CCLE)和The human protein atlas等多个数据库,探讨线粒体核糖体蛋白L13(MRPL13)在乳腺癌组织与正常乳腺组织的表达差异,并进一步分析MRPL13表达与乳腺癌患者预后的关系.方法 首先利用Oncomine和cBioPortal数据库分析MRPL13在乳腺癌和正常乳腺组织中的表达差异,用CCLE数据库分析MRPL13在乳腺癌细胞系中的表达情况,并利用The human protein atlas数据库观察MRPL13蛋白水平的表达变化.接着,通过String数据库建立MRPL13的共表达网络,并且利用DAVID数据库对共表达网络进行GO生物学功能和KEGG信号通路富集分析.最后利用cBioPortal和Kaplan-Meier Plot在线分析网络工具探索分析MRPL13表达变化与乳腺癌患者生存期的关系.结果 Oncomine数据库发现MRPL13在乳腺癌中高表达(P=5.55×10-9),cBioPortal数据库显示816例乳腺癌患者样本中有43% 的MRPL13基因表达上调.同样在CCLE数据库也发现MRPL13在乳腺癌细胞系中高表达,3个数据库结果一致.The human protein atlas数据库发现MRPL13蛋白中等程度表达且主要集中表达在细胞质与细胞膜内.cBioPortal和Kaplan-Meier Plotter网络在线分析均显示乳腺癌患者中MRPL13高表达能显著降低乳腺癌患者生存期,差异均有统计学意义(P<0.05).结论 相较于正常组织,MRPL13在乳腺癌中高表达,且提示乳腺癌患者预后不良,可作为乳腺癌患者预后评估的分子标志物之一.
乳腺癌、线粒体核糖体蛋白L13、数据库
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R734.2(肿瘤学)
重庆市科卫联合项目2018MSXM020
2020-04-22(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
共7页
836-841,845