应用焦磷酸测序技术检测VKORC1和CYP2C9基因型

摘要：

目的 建立基于焦磷酸测序技术的维生素 K环氧化物还原酶复合物亚单位1(V KORC1)和细胞色素P4502C9(CYP2C9)基因分型的方法,用于检测华法林药物代谢酶相关基因多态性.方法 收集50份健康人外周血样本,提取全血基因组 DNA.针对 VKORC1 -1639G > A、CYP2C9430C > T 和 CYP2C91075A>C 3个单核苷酸多态性(SNP)位点,分别设计一套带生物素标记的扩增引物和测序引物.样本经PCR扩增后进行焦磷酸测序,结合信号峰型分析每个样本基因型,以Sanger测序法为对照,比较两种方法检测基因型结果的一致性.结果 根据待测位点出峰的碱基和峰高,可以清晰判断3个SN P位点的基因型,50份样本中,VKORC1 -1639G>A基因型AA和AG分别有41例和9例,各占82% 和12%;CYP2C9基因型 *1/*1和*1/*3分别有45例和5例,各占90% 和10%,未检出等位基因CYP2C9*2.焦磷酸测序技术与Sanger测序法所检测的基因型结果一致.结论 焦磷酸测序技术在SNP基因分型中具有操作简便、耗时短、成本低和结果准确可靠等优点,该检测方法可快速对CYP2C9和VKORC1的SNP位点进行分型.

关键词：焦磷酸测序、华法林、CYP2C9、VKORC1、单核苷酸多态性

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分类号：R596.2(全身性疾病)

资助基金：贵州省高层次创新型人才培养计划---"百"层次人才黔科合平台人才[2016]5670号;贵阳市科技创新平台计划[20161001]35号

在线出版日期：2018-05-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：769-772