节律基因NPAS2在肺腺癌中的临床意义

摘要：

目的:探究NPAS2基因在肺腺癌(LUAD)中的表达及其与相关临床参数的关联，分析其对患者总生存期(OS)的影响及在LUAD预后中的预测价值。方法:从癌症基因组图谱数据库(TCGA)中下载LUAD转录组测序及临床资料数据，分析LUAD肿瘤组织与正常肺组织中NPAS2的表达差异。收集LUAD患者肿瘤组织及正常肺组织应用蛋白免疫印迹法(WB)检测NPAS2蛋白表达，并分析TCGA数据库中NPAS2表达与LUAD患者肿瘤分期及OS的关联。通过基因集富集分析(GSEA)挖掘NPAS2潜在的致癌机制。结果:TCGA差异分析显示NPAS2 mRNA在LUAD肿瘤组织1.83(1.01，3.01)中的表达水平高于正常肺组织，0.74(0.49，1.15)，差异有统计学意义(
Z＝7.21，
P<0.05)；配对分析显示NPAS2 mRNA在LUAD组织1.82(1.37，3.08)中的表达也高于配对的正常肺组织0.76(0.51，1.16)，差异有统计学意义(
Z＝5.63，
P<0.05)。WB结果显示，NPAS2蛋白在LUAD 0.62(0.40，1.36)中的表达水平高于正常肺组织0.14(0.08，0.58)，差异有统计学意义(
Z＝2.71，
P<0.05)。在亚组分析中，与T1~2组相比，T3~4组中NPAS2 mRNA高表达的比例更高1.81(1.01，2.92)比2.10(1.29，3.71)(
Z＝2.12，
P<0.05)；在预后分析中，NPAS2高表达组患者的预后相对较差，与NPAS2 mRNA低表达组比较差异有统计学意义(
χ2＝9.66，
P<0.05)，Kaplan-Meier plotter数据库显示NPAS2 mRNA高表达LUAD患者预后更差(
HR＝2.19，
P<0.05)，Cox比例风险模型进行多因素分析表明更高的TNM分期(
HR＝2.12，
P<0.05)及NPAS2 mRNA高表达(
HR＝1.21，
P<0.05)预后更差，与NPAS2低表达患者相比，NPAS2高表达患者OS更短(
P<0.05)；GSEA基因富集结果显示NPAS2高表达时，肿瘤、小细胞肺癌、细胞外基质受体相互作用、凋亡、白细胞跨内皮迁移、ERBB等通路相关基因显著富集。
结论:NPAS2在LUAD中高表达，并与肿瘤局部浸润和OS相关，可以作为LUAD独立的预后预测因子。

关键词：肺腺癌、预后、NPAS2基因、基因集富集分析

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资助基金：国家自然科学基金82074231;National Natural Science Foundation of China82074231

在线出版日期：2023-05-30（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1801-1808