北京市怀柔区2013—2018年间甲型H1N1流感病毒血凝素基因进化分析

摘要：

目的 分析北京市怀柔区2013—2018年间甲型H1N1流感病毒血凝素(HA)基因的变异情况,了解其遗传进化特征.方法 选取北京市怀柔区2013—2018年间不同监测年度、明确鉴定为甲型H1N1流感病毒亚型的细胞培养阳性毒株42株,通过RT-PCR扩增、测序并获得HA基因序列.运用MEGA 6.0软件分析HA的分子特征,构建系统进化树.结果 2013—2018年间各监测年度流感病毒株与疫苗株A/California/07/2009的HA基因核苷酸的平均遗传距离分别为0.017、0.020、0.028、0.027、0.033.系统进化树结果显示,甲型H1N1流感病毒有两大分支:2013—2015年聚集至A/California/07/2009分支;2016—2018聚集至A/Michigan/45/2015(6B.1)分支.HA抗原位点发生变异的有10处,包括S220T、P154S、H155Y、E252G、S91R、K180Q、S181T、S179N、S202T、A203V.结论 北京市怀柔区2013—2018年甲型H1N1流感病毒HA基因在不断地发生变异,与2009年疫苗株的距离在逐渐增加,抗原决定簇变异频率增高、基因的多样性增加,均提示监测流感病毒分子特征的重要性.

关键词：甲型H1N1流感病毒、血凝素、分子特征、进化分析

所属期刊栏目：26

资助基金：怀柔区卫生和计划生育委员会科研项目2017-C-002;Research Program of Health and Family Planning Commission of Huairou District2017-C-002

在线出版日期：2019-09-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：261-265