GII.P21/GII.3型重组诺如病毒的分子特征分析

摘要：

目的 对两株GII.P21/GII.3型重组诺如病毒的主要基因片段进行扩增,并对其分子特征进行初步分析.方法 利用普通RT-PCR对两个毒株的部分聚合酶区及完整衣壳蛋白区片段进行扩增和序列测定.通过BioEdit及MEGA软件进行序列比对及进化分析,Simplot软件进行重组位点分析.结果 序列分析显示,2株诺如病毒在聚合酶区与衣壳蛋白区均和2009—2011年的越南株处于同一小的分支,该分支毒株间的相似性分别为97.3％～98.9％及96.8％～98.1％;可能的重组位点在第701位核苷酸,位于病毒的开放读码框架1上;各簇毒株均出现不同程度的氨基酸位点突变,3个受体结合位点及两个抗原位点无变异,但与受体结合位点II相邻的氨基酸385位点出现了变异.结论 江苏省存在GII.P21/GII.3型诺如病毒的感染.

关键词：诺如病毒、基因型、重组

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资助基金：南京市医学科技发展项目YKK17183;南京医科大学科技发展项目2017NJMU074;Medical Science and Technology Development Foundation, Nanjing Department of HealthYKK17183;Science and Technology Development of Nanjing Medical University2017NJMU074

在线出版日期：2019-09-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：233-236