基于生信分析赵琦教授对三仁汤主药治疗结直肠腺瘤的预测研究

摘要：

目的 利用生物信息分析方法预测探索三仁汤中主药成分苦杏仁、薏苡仁、半夏化学组分治疗人类结直肠腺瘤(colorectal adenoma,CRA)的效应靶基因.方法 从公共基因芯片数据库 GEO 筛选符合纳入条件的人CRA腺瘤全基因组 RNA芯片(样本为CRA患者和正常人的结直肠黏膜组织)利用 GCBI在线实验室筛选出 CRA与正常组织的差异基因数据集①;从 BATMAN-TCM、TCMSP苦杏仁、薏苡仁、半夏中药成分数据库搜寻所含药物成分作用的效应基因数据集②,分别对上述两个数据集及两者的交集通过 STRING进行 GO富集分析、KEGG通路分析以及参与生物功能的蛋白相互作用网络分析(MCODE分析).结果 从符合研究纳入条件的4 块 CRA与常人黏膜组织的基因芯片数据集最终得到 246 个差异性基因,从 TCMSP、BATMAN-TCM中药化合物数据库查到苦杏仁、薏苡仁、半夏的药物调节基因交集后得到 115 个,数据集①②交集得到 MYC(Myc proto-oncogene pro-tein)、HNF4A(Hepatocytenuclear factor 4-alpha)、GCG(Glucagon)共 3 个潜在效应靶基因,后续生信分析及文献回溯证实这 3 个基因与细胞生长、周期调节及有丝分裂密切联系,尤其结肠腺瘤、癌相关通路密切联系,预示三仁汤有可能通过调节CRA黏膜细胞分裂增殖达到治疗效果.结论 利用生物信息学有助于中药成分针对 CRA黏膜组织的治疗效应靶基因进行探索,为进一步的实验研究指明方向,提供理论依据.

关键词：结直肠腺瘤、生物信息分析、靶基因、中药

所属期刊栏目：43

分类号：R34;R963(人体生物化学、分子生物学)

资助基金：贵阳中医学院院内基金项目,课题编号:贵中医科院内201818号

在线出版日期：2020-03-28（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：1859-1862