‘库尔勒香梨’miR159家族成员进化特性及表达分析
[目的]了解‘库尔勒香梨’miR159家族成员的进化特征及其在萼片脱落与宿存中的作用.[方法]以‘库尔勒香梨’Small RNA高通量测序中获得的miR159家族前体序列和成熟体序列为基础进行系统发育树构建、前体和成熟体的序列比对、前体二级结构预测、WebLogo保守性分析、靶基因预测和表达量分析.[结果]‘库尔勒香梨’miR159家族存在2个前体成员(psi-MIR159a、psi-MIR159c)和2个成熟体成员(psi-miR159a、psi-miR159c).2个前体成员的序列均能形成典型稳定的茎环结构,且序列完全一致,它们的最小折叠自由能(dG)都为-93.95 kal· mol-1.系统发育进化树显示,‘库尔勒香梨’和苹果MIR159家族亲缘关系很近.WebLogo分析表明,miR159家族成熟体的保守性很高,其保守序列为5’-UUUGGAUUGAAGGGAGCUCUAUU-3’,但‘库尔勒香梨’的碱基保守性较低.靶基因预测显示,‘库尔勒香梨’miR159基因家族靶基因为转录因子bHLH91、BES1/BZR1同源蛋白4、热激70 ku蛋白质、Trihelix转录因子GT-1、G型凝集素S-受体类丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶RLK1等.实时荧光定量PCR(qPCR)显示,‘库尔勒香梨’miR159家族的2个成员在初花期、盛花期和末花期3个时期萼片脱落组和宿存组的表达量有显著差异.[结论]‘库尔勒香梨’miR159家族在进化过程中既有保守性又有多样性,可能在萼片脱落过程中起作用.
’库尔勒香梨’、miR159家族、进化特性、表达模式
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S661.2(果树园艺)
国家自然科学基金31360474;高等学校博士学科点专项科研基金博导类联合资助课题2013651810002
2019-03-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
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