三种葡萄病毒的RT-PCR检测和系统进化分析

摘要：

[目的]为了研究不同葡萄病毒病快速检测方法和四川分离株系统进化,[方法]比较3种葡萄总RNA提取方法,还优化了葡萄病毒病的RT-PCR检测方法.分别克隆了3种病毒四川分离株的部分基因组区域,并开展了系统进化分析.[结果]结果表明,改进硅胶颗粒吸附法快速从葡萄枝条的韧皮组织中提取了总RNA,并以葡萄18SRNA为内参基因,RT-PCR分别成功扩增出3种病毒的目的片段.把16个地理起源的GLRaV-2分离株的外壳蛋白基因(Coat protein,CP)分成5个系统进化组.而7个地理起源的GVB分离株CP同源性为79.1％～98.7％.此外,5个GVA四川分离株分别位于系统进化树的4个聚类群.[结论]GLRaV-2、GVB和GVA不同地理起源的分离株在核酸水平上具有变异性,其中GVA四川分离株之间具有显著的遗传差异,可能包括4种株系.

关键词：葡萄卷叶伴随2型病毒、葡萄B病毒、葡萄A病毒、病毒外壳蛋白基因、病毒沉默抑制子基因

所属期刊栏目：30

分类号：S663.1(果树园艺)

资助基金："十二五"四川省财政基因工程:果树生物技术研究与创新2011JYGC05-018

在线出版日期：2013-07-04（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：197-201