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西瓜交替氧化酶AOX2基因的克隆与分析

引用
为了研究西瓜交替氧化酶基因家族在西瓜植株中可能发挥的功能,以西瓜(Citrullus lanatus)耐冷种质IVSM9为材料,根据植物不同物种交替氧化酶基因核苷酸保守区序列设计兼并引物,得到西瓜交替氧化酶(alterna-tive oxidase)AOX基因的中间片段。在已知序列的基础上,分别设计5’和3’末端扩增的特异引物,采用cDNA末端快速扩增(RACE)的方法得到西瓜交替氧化酶基因的5’端和3’端序列,用DNAMAN5.22软件对3个序列进行拼接和分析,获得全长序列。得到的基因片段同其他物种AOX基因家族中的alternative oxidase-2(AOX2)基因具有高度的同源性,因此命名ClAOX2。根据拼接得到的cDNA全长序列设计5’和3’两端引物,得到ClAOX2基因DNA和cDNA的全长序列。该基因cDNA全长为1 263 bp,开放阅读框架为1 050 bp,编码349个氨基酸。DNA全长1 983bp,存在3个内含子。目前该基因已在GenBank注册,登录号为ADD84880。荧光定量分析表明,ClAOX2基因在西瓜根、茎、叶、花、果等各个组织中均有表达,且在果实中的表达量最高。因此推测该基因可能在西瓜果实的发育中发挥作用。

西瓜、交替氧化酶、克隆、基因表达

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S661.1(果树园艺)

国家自然科学基金NSFC30771478;国家现代农业产业技术体系CARS-26-17;国家高技术研究发展计划863计划2010AA10A107-2

2012-04-21(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)

909-914

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1009-9980

41-1308/S

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2011,28(5)

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