菠萝基因组SSR分子标记的开发

摘要：

实验采用SAM法,以"台农17号"菠萝作为开发基因组SSR分子标记的植物材料,并对开发获得的SSR标记在16个菠萝品种中进行了验证.利用两对锚定引物和12对接头引物筛选菠萝基因组SAM文库,从中开发得到86条含有SSR位点的序列,对这86条序列用MISA软件搜索后得到94个SSR位点.其中单核苷酸重复3个,二核苷酸重复91个.二核苷酸重复仅有2种重复单元,一种是GM/CT,占二核苷酸重复总数的57.14%(52/91),另一种是AC/GT,占二核苷酸重复总数的42.86%(39,91).研究未发现三核苷酸及以上的重复单元.36对SSR引物对16个材料的扩增结果显示,24对引物能够扩增出清晰、重复性好且符合预期大小的条带,其中13对引物具有多态性,可成为下一步构建菠萝指纹图谱、遗传多样性分析及基因定位等研究中有用的SSR标记.

关键词：菠萝、基因组SSR标记、开发、验证

所属期刊栏目：27

分类号：S668.3(果树园艺)

资助基金：国家科技基础条件平台重点项目2005DKA21000-5-43

在线出版日期：2010-10-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：551-555