全长转录组测序技术解析不同转移性能肝癌细胞系的转录本表达谱与结构变异

摘要：

为了更好地研究肝细胞癌的转移机制,并筛选出与肝癌预后密切相关的潜在靶点,本研究利用纳米孔长读长测序技术对两株不同转移潜能的肝癌细胞(MHCC97H与MHCC97L)进行全长转录组比较分析.通过生物信息学分析发现643个新基因(Novel gene)和2471个新转录本(New transcripts).在这两株细胞中有293个差异表达基因及74个差异表达转录本.在结构变异分析中鉴定出1008个可变剪切事件,其中外显子跳跃占比最多.本研究通过全长转录组测序进一步完善了肝癌细胞的基因注释及基因表达分析,为揭示肝细胞癌的转移分子机制提供了新的研究思路与线索.

关键词：肝细胞癌;转录本表达谱;mRNA可变剪切;全长转录组测序;纳米孔测序

所属期刊栏目：41

分类号：R735.7(肿瘤学)

在线出版日期：2021-09-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：818-825,868