基于宿主基因表达谱的结核诊断组合标识的发现和同步检测技术研发

摘要：

目的:开发结核诊断新标识.方法:利用特征选择方法从20个基因中选取3个基因(CD157、GSDMD和VAMP5)可用于初步区分肺结核患者(59例)与非结核人群(188例);采用Taqman单管同步检测技术验证3个基因的重复性,比较其在新鲜和冻存外周血中的表达量;最后通过神经网络(neural network,NNET)建立用于区分肺结核患者和非结核的分类诊断模型.结果:建立并验证了Taqman单管同步检测3个基因的实时荧光定量技术;通过3个基因的组合(CD157、GSDMD和VAMP5)构建了可用于区分肺结核(158例)与非结核(157例)的NNET模型,该模型对区分肺结核的准确度、灵敏度与特异性分别为0.77(95％CI:0.72,0.82)、0.80(95％CI:0.72,0.86)和0.75(95％CI:0.68,0.82),曲线下面积(area under curve,AUC)为0.85(95％CI:0.80,0.89);在来自独立测试集样本中(包含33个结核样本,35个非结核样本),该模型对区分肺结核的准确度、灵敏度和特异性分别为:0.75(95％CI:0.63,0.85)、0.74(95％CI:0.57,0.88)和0.76(95％CI:0.58,0.89),AUC为0.84(95％CI:0.80,0.89).结论:鉴定出了能够用于区分和诊断结核的三基因组合标识,开发出了可以单管同步检测分析该3个基因的技术,用于临床上快速筛查诊断结核患者.

关键词：结核/诊断;神经网络;单管同步检测

所属期刊栏目：41

分类号：R446.6;R52(诊断学)

资助基金：广东省组织器官区域免疫与疾病重点实验室项目;国家自然科学基金青年项目;深圳市学科布局重点项目;广东省绿色发展、可持续发展和人民群众生活需要的科技项目

在线出版日期：2021-09-16（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：784-790