GPC1基因调节结直肠癌进展及预后的生物信息学分析

摘要：

目的:利用生物信息学分析方法,分析GPC1基因在结直肠癌进展及预后中的作用,并预测可能的分子机制.方法:从TCGA数据库下载COAD转录数据及临床病理信息,通过Perl软件提取基因表达量,使用GSEA对基因集进行糖酵解相关通路富集及差异基因筛选.通过R软件limma包对差异基因进行单因素及多因素COX分析,筛选出6个相关基因并验证.然后分析6个相关基因的表达水平与COAD不同临床病理特征的相关性,其中GPC1基因具有相关性.最后通过R软件进行KEGG富集分析及相关靶基因相关性分析,预测目标基因调控结直肠癌进展预后的可能分子机制.结果:GPC1基因在COAD组织中高表达(P<0.001),与肿瘤的分级、TNM分期具有相关性(P<0.05).皮尔森检验显示,GPC1与TGF-β1,VEGFB呈中等强度相关.结论:GPC1可能通过增强TGF信号通路和VEGF信号通路影响结直肠癌细胞的增殖、侵袭及结直肠癌的预后.

关键词：结直肠癌、GPC1、生物信息学分析、进展及预后、糖酵解

所属期刊栏目：41

分类号：R363(病理学)

资助基金：国家自然科学基金项目;安徽省自然科学基金项目;蚌埠医学院转化医学重点专项课题;蚌埠医学院科研创新团队;蚌埠医学院512人才培养计划项目;蚌埠医学院研究生科研创新计划项目

在线出版日期：2021-05-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：241-250