新型冠状病毒棘突蛋白免疫原性分析及其多肽疫苗设计研究

摘要：

目的:分析新型冠状病毒(SARS-CoV-2)表面棘突蛋白的结构和B细胞表位.方法:首先利用Protparam 对SARS-CoV-2棘突蛋白的物理化学性质特征进行分析.随后通过Clustal软件,对SARS-CoV-2和SARS-CoV棘突蛋白中的功能区域进行分析,并结合同源模拟,明确棘突蛋白的空间结构和折叠特征.综合DNAStar、ABCpred和BepiPred结果,筛选SARS-CoV-2棘突蛋白的线性B细胞表位,同时利用ElliPro、DiscoTope、SEPPA对棘突蛋白的构象B细胞表位进行综合预测.结果:通过同源模拟,SARS-CoV-2的棘突蛋白是同源三聚体结构,并且与SARS-CoV的棘突蛋白相似,也具有两种受体结合区域构象.通过综合多种免疫信息学工具及进一步筛选,11条线性表位(B9-B14和B27-B31)及5条构象表位(CB4-CB8)被筛出.结论:本研究筛选出的SARS-CoV-2棘突蛋白的16条B细胞表位,包括11条线性表位(B9-B14和B27-B31)及5条构象表位(CB4-CB8),可作为潜在的新型冠状病毒肺炎免疫原疫苗研发的候选表位.

关键词：新型冠状病毒、新型冠状病毒肺炎、三维结构模拟、B细胞表位

所属期刊栏目：40

分类号：R392.11

资助基金：赣南医学院COVID-19应急项目YJ202014

在线出版日期：2020-07-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：217-224