基于生物信息学分析和预测人骨肉瘤中Gab2靶向作用的miRNA分子

摘要：

目的:通过生物信息学软件分析和预测在人骨肉瘤中能够靶向结合Gab2的miRNA.方法:首先通过生物信息学软件mirWalk 2.0预测可以靶向结合Gab2的miRNA,然后用miRanda得到Gab2-miRNA的热力学稳定性评分和序列保守性评分.并通过入骨肉瘤miRNA芯片GSE70367得到在人骨肉瘤中差异表达的miRNA.在生物信息学软件打分较高的miRNA中选出差异表达的miRNA,从而选出人骨肉瘤中能与Gab2结合的特异性最强,稳定性最高的miRNA.结果:mirWalk 2.0预测有22个miRNA可与Gab2靶向结合;其中,miR-1236-3 p、miR-218-5p与Gab2结合的稳定性和特异性最好;在入骨肉瘤中差异表达的miRNA有184个,而miR-218-5p的表达也存在差异性,并且表达下调.结论:在人骨肉瘤中miR-218-5p可能靶向结合于Gab2,Gab2是miR-218-5p的靶基因.

关键词：人骨肉瘤、生物信息学、Gab2、miRNAs、靶基因

所属期刊栏目：39

分类号：R730.2(肿瘤学)

资助基金：国家自然科学基金项目81660371;江西省教育厅科技青年项目GJJ170886

在线出版日期：2019-08-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：433-439,445