水稻基因组MSAP指纹图谱构建及DNA甲基化修饰位点分离与鉴定

摘要：

采用EcoR I和Hpa II/Msp I双酶切建立了适合于水稻基因组的甲基化敏感扩增多态性(MSAP)分析体系,在全基因组水平检测了水稻DNA甲基化修饰位点.以12对MSAP引物进行选择性扩增,共检测到甲基化修饰位点120个,"CCGG/GGCC"位点甲基化修饰比例为20.17%.对部分水稻基因组甲基化修饰位点进行回收,最终分离了55条存在甲基化位点变异的DNA序列,通过BLAST比对分析将其联配到水稻基因组序列上.分析表明,这些甲基化修饰位点主要集中于基因启动子区(47%)和第一外显子区(22%),在其侧翼序列中存在类似"CpG island" 典型序列特征的"CpG"二核苷酸成簇富集区.在此基础上,对应用MSAP技术分离水稻基因组DNA甲基化修饰位点的有效性以及水稻基因组序列中"CpG island"类似序列分布特征和生物意义进行了讨论.

关键词：水稻、表观遗传、DNA甲基化、甲基化敏感扩增多态性(MSAP)、CpG岛

所属期刊栏目：19

分类号：S51;S60

资助基金：国家自然科学基金30671136、30730065;国家博士后科学基金20070411158;电子科技大学青年基金

在线出版日期：2009-11-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：983-990