基于Java的基因本体工具包

摘要：

针对基因本体的需求,利用Java技术,以模块化设计的方式实现了基因本体工具包GO4J.该系统包括4个模块.解析器模块把GO载入到内存中;图数据结构模块记录了所有的GO条目之间的关系;语义相似性模块评估两个GO条目之间的相似程度;可视化模块直观展示GO条目和根节点之间的路径.GO4J把这4个模块整合到本体浏览器中,可以结合GO注释的生物数据来对具体的生物数据进行分析.

关键词：基因本体、解析器、图模型、语义相似性

所属期刊栏目：16

分类号：Q81(生物工程学(生物技术))

资助基金：高比容电子铝箔的研究开发与应用项目2003AA231011;科技部科研项目2003CB715900;2004CB518606

在线出版日期：2006-08-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：735-739