基于DNA序列LZ复杂性距离的系统进化树重构

摘要：

根据LZ复杂性的原理,提出了序列间条件LZ复杂性的概念.基于条件LZ复杂性,定义了非空序列间的LZ复杂性距离.选取20种有胎盘哺乳动物,以它们的全线粒体基因组作为分子数据,计算两两之间的LZ复杂性距离,得出距离矩阵.根据计算出的LZ复杂性距离矩阵重构了20种有胎盘哺乳动物的系统进化树.基于LZ复杂性距离所得的系统进化树支持有胎盘哺乳动物中的灵长动物(Primates)、原蹄动物(Ferungulate)和啮齿动物(Rodents)三者之间灵长动物与原蹄动物之间亲缘关系更近一些的观点.

关键词：生物信息学、系统进化树重构、条件LZ复杂性、LZ复杂性距离

所属期刊栏目：16

分类号：Q81(生物工程学(生物技术))

资助基金：中国科学院资助项目60371046

在线出版日期：2006-06-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：506-510