基于XML构建生物信息二级数据库

摘要：

提出并实现了一种生物信息二级数据库的构建方法.该方法采用NCBI维护的一级数据库作为核酸和蛋白质序列数据来源,以Oracle 9i作为后台软件,所有的应用程序基于Java开发.通过代理程序自动获取Web数据,并以XML作为中间格式保存,然后通过解析提交到二级数据库中,同时转换成便于Web发布的HTML格式.该方法既方便对语义的机器解析,又有效地保证入库信息的完整性,显著提高了二级数据库的开发效率.

关键词：生物信息学、二级数据库、可扩展标记语言

所属期刊栏目：16

分类号：Q1(普通生物学)

在线出版日期：2006-04-26（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：281-285