栉孔扇贝脂多糖葡聚糖结合蛋白(LGBP)基因的克隆及其特征分析

摘要：

作为模式识别蛋白的脂多糖葡聚糖结合蛋白 (Lipopolysaccharide and beta-1,3-glucan binding protein,LGBP)在无脊椎动物的免疫系统中发挥着重要作用.本研究以鳗弧菌作为病原感染栉孔扇贝,构建全个体cDNA的质粒文库,用T3引物对文库进行随机测序得到一个667bp的cDNA片段(编号:cl305ct320cn336),它与普通蚯蚓的体腔裂解因子前体基因、海胆的β-1,3 -葡聚糖酶、非洲疟蚊的革兰氏阴性细菌结合蛋白等有同源性.用T7引物对该克隆测序得到其3'末端.通过SMART-RACE技术克隆得到该克隆的全长cDNA序列.栉孔扇贝LGBP基因由1850个核苷酸组成,它有一个poly A 尾巴,编码一条440个氨基酸的多肽.该多肽的分子量估计为47159.076Da,等电点为5.095.推导的氨基酸序列与蓝虾、斑节对虾、海胆、非洲疟蚊、淡水螯虾、普通蚯蚓及普通红蚯蚓等无脊椎动物模式识别蛋白具有高度的同源性.经用Garnier法预测,栉孔扇贝LGBP的二级结构包含螺旋构象10%, 折叠片构象17%,转角构象21%,无规则卷曲53%,各种构象所占比例与普通红蚯蚓的体腔裂解因子前体相近.

关键词：栉孔扇贝、脂多糖葡聚糖结合蛋白、基因克隆

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分类号：Q78(基因工程（遗传工程）)

资助基金：国家高技术研究发展计划863计划2002AA626020;国家重点基础研究发展计划973计划G1999012008;国家自然科学基金40276045

在线出版日期：2004-05-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：87-91