子痫前期胎盘组织中差异表达基因及其临床意义
目的 探讨子痫前期患者相较正常孕妇胎盘组织中差异化表达基因及其临床意义,旨在揭示子痫前期可能的发病机制,为临床治疗奠定基础.方法 选择23例足月正常妊娠孕妇为对照组,26例子痫前期患者为观察组;对照组平均分娩孕周为40周,观察组平均分娩孕周为35周;两组平均年龄差异无统计学意义(P>0.05);两组均符合入组标准.采用Trizol法,选择对照组中的3例及观察组中的6例,提取其胎盘组织mRNA,将mRNA逆转录成cDNA,构建出文库.以Illumina HiSeq X10高通量测序平台对mRNA表达谱进行测序分析,在分子水平以FDR<0.05且|log2 FC|>1.2为标准筛选出两组胎盘组织差异表达基因.对差异表达基因进行GO term、KEGG pathway及DO term分析,应用生物信息学方法分析与子痫前期发生、发展密切相关的基因及关键信号通路.利用实时荧光定量PCR,选择对照组20例,观察组20例,验证差异表达基因.结果 9例测序样本均建库成功,样本标记为正常妊娠组(CK)、早发型子痫前期组(T1)、晚发型子痫前期组(T2),每组设置3个生物学重复,分别记作CK-1、CK-2、CK-3、T1-1、T1-2、T1-3、T2-1、T2-2、T2-3.平均每个文库的测序数据Q30>90％,说明测序数据质量可信,可用于后续进一步分析.观察组与对照组比较,观察组共发现51个差异化基因,其中12个基因表达上调,39个基因表达下调(Fold change>1,P<0.05);早发型子痫前期组与对照组比较,早发型子痫前期组共发现35个差异化基因,其中11个基因表达上调,24个基因表达下调(Fold change>1,P<0.05);晚发型子痫前期组与对照组比较,晚发型子痫前期组共发现51个差异化基因,其中16个基因表达上调,35个基因表达下调(Fold change>1,P<0.05);早发型子痫前期组与晚发型子痫前期组比较,早发型子痫前期组共发现32个差异化基因,其中15个基因表达上调,17个基因表达下调(Fold change>1,P<0.05).GO功能注释显示差异基因主要参与的生物过程有:免疫调节、炎症反应及细胞因子代谢等.KEGG分析显示差异基因主要富集的信号通路有:Toll样受体信号通路、Notch信号通路、HIF-1信号通路和脂肪细胞因子信号通路等.DO分析显示差异基因主要富集的疾病有:免疫系统疾病、血管功能障碍、肥胖、糖尿病、代谢综合征等.通过对GO、KEGG和DO综合分析,筛选出4个差异表达基因(ENG、TREM1、APLN和RGS5).采用qRT-PCR技术验证上述筛选出的差异表达基因,结果显示,相比于正常妊娠,ENG、TREM1在子痫前期胎盘组织中表达上调,差异有统计学意义(P<0.05);APLN、RGS5在子痫前期胎盘组织中表达下调,差异有统计学意义(P<0.05).结论 子痫前期是一种多基因多通路疾病,其发病机制涉及多个生物学过程和信号通路的改变.ENG、TREM1、APLN和RGS5基因可能与子痫前期的发病有关.
子痫前期、高通量测序、差异表达基因、生物信息学
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R714;R34(妇产科学)
广州市科技计划项目202102080493
2023-10-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共8页
1142-1149
