肾透明细胞癌染色质调节因子相关预后风险模型的构建和验证
目的 通过生物信息学方法鉴定肾透明细胞癌(ccRCC)预后相关的染色质调节因子(CRs),构建并验证一种新型染色质调节因子相关的预后风险模型.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库和Ar-rayExpress数据库分别下载了TCGA-KIRC队列和E-MTAB-1980 队列的转录组信息和临床信息.首先使用R包在TCGA数据集中识别癌与癌旁中差异表达的CRs.随后,通过单因素和多因素Cox回归分析确定预后相关的CRs并在训练队列中构建风险模型.根据风险评分的中位数将患者分为高风险组和低风险组.Kaplan-Meier 生存分析用于比较高、低风险组之间的总生存期(OS).受试者工作特征(ROC)曲线的曲线下面积(AUC)值用于评估模型的效能,并在测试队列和E-MTAB-1980 外部队列中进一步验证.结果 构建了一个4 基因预后风险模型,生存分析表明高风险组患者的OS较短.在训练队列中,该模型预测1、3、5 年OS的ROC曲线的AUC值分别为0.722、0.677、0.762.在测试队列和E-MTAB-1980 外部队列中,该模型仍然表现出满意的效能.用于构建模型的4 个CRs的表达情况也通过转录组测序得到验证,且风险评分是ccRCC的独立预后因素.此外,高风险组拥有更高的免疫活性和免疫细胞浸润水平.结论 本研究揭示了CRs在ccRCC中的重要作用.染色质调节因子相关的风险模型可以准确预测ccRCC患者的预后.
染色质调节因子、肾透明细胞癌、预后模型、生物信息学
R737.11;R394(肿瘤学)
广东省医学科学技术研究基金项目A2022232
2023-09-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共9页
873-881
