乳腺浸润性导管癌中lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络的整合分析
目的 构建乳腺浸润性导管癌的特异性ceRNA调控网络.方法 收集68例乳腺浸润性导管癌组织以及14例乳腺良性组织,以ANOVA P<0.05且|Fold Change(linear)|>2为基因差异表达筛选标准,采用人类全转录组基因表达谱HTA2.0芯片和miRNA4.0芯片来检测lncRNAs、mRNAs和miRNAs的表达;利用GDCRNATools包分析三者之间的ceRNA调控关系并用Cytoscape进行可视化;最后采用商业软件IPA分析差异表达的mRNAs参与的生物学功能.结果 与乳腺良性组织相比,乳腺浸润性导管癌组织中有513个mRNAs、293个lncRNAs和165个miRNAs存在差异表达;所构建的特异性ceRNA子网络,主要由4个lncR-NAs、3个miRNAs和61个mRNAs组成;异常表达的mRNAs在细胞学功能方面主要涉及到肿瘤细胞运动、细胞生长和增殖、细胞周期、侵袭和转移等.结论 构建了乳腺浸润性导管癌组织的特异性ceRNA网络,从而为进一步探讨网络中核心分子间的表达调控机制奠定基础.
乳腺癌、浸润性导管癌、长链非编码RNA、miRNA、竞争性内源RNA
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R737.9;R392(肿瘤学)
深圳市科技计划基础研究项目JCYJ20170307165048482
2022-08-11(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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