人骨髓间充质干细胞成骨分化相关的长链非编码RNA 表达谱特征
目的:观察人骨髓间充质干细胞(hMSCs)成骨分化过程中长链非编码 RNA(lncRNA)的表达谱变化。方法以 hMSCs 及成骨诱导分化7、14、21 d 后的细胞为研究对象,利用 Agilent lncRNA 芯片技术筛选出成骨诱导分化前后2倍变化幅度的差异 lncRNA,并通过实时荧光定量 PCR(RT - PCR)对芯片结果进行验证。选取筛选结果中表达差异较大的 lncRNA 利用 UCSC Genome Browser 并结合芯片筛选结果分析 lncRNA 邻近蛋白编码基因。结果 hMSCs 经成骨诱导分化7、14、21 d 后,均具有成骨细胞特性;芯片筛选结果表明,与成骨诱导分化前的hMSCs 相比,成骨诱导分化7、14、21 d 后持续表达上调超过2倍的 lncRNA 有433条,下调超过2倍的有232条;选取其中部分 lncRNA,RT - PCR 验证与芯片结果相符合;对 lncRNA 邻近蛋白编码基因分析提示某些 lncRNA(如lncRNA ENST00000585537.1和 lncRNA eHIT00001595)可能在 hMSCs 成骨分化过程中发挥重要作用。结论 hM-SCs 成骨诱导分化前后,lncRNA 表达谱发生显著变化,提示差异表达的 lncRNA 可能与 hMSCs 成骨分化密切相关,由此可进一步解释 hMSCs 成骨分化机制。
人骨髓间充质干细胞、成骨分化、长链非编码RNA
R31;TB3
广东省科技计划项目编号2013B021800153;广州市科技惠民专项项目编号2014Y2-00109
2015-07-07(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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