广东地区GBV-C/HGV5'NCR区序列变异的研究

摘要：

目的了解广东地区GBV-C/HGV 5′NCR区的序列变异情况.方法以GBV-C和HGV的5′NCR区完全同源的序列设计合成引物用于套式RT-PCR.从广东地区的10例GBV-C/HGV感染者血中扩增了10个序列,分别克隆至pUC19或pT-Adv载体.以35 S标记的双脱氧链末端终止法对这10个序列分别进行正反两个方向的序列测定.结果 10株序列相互间同源性最大为100%,最小为84.4%.与Genbank所载3个标准株的相应序列比较,其同源性最大为89.4%,最小为83.9%.与国内周育森报道的相应序列比较,两者之间的同源性最大为96.1%,最小为85.0%.比较还发现,这10株序列的起始处有一段38 nt的区域与上述标准序列相比变异比较大,其与标准序列的同源性最高只有79.0%,最低为60.5%.其中9株相互间的这一38 nt序列的同源性则高达92%～100%.结论广东地区流行的庚型肝炎病毒大多带有HGV的特殊点.少数为GBV-C.

关键词：克隆、分子、序列分析、DNA、肝炎病毒组、庚型、聚合酶链反应

所属期刊栏目：21

分类号：R3(基础医学)

资助基金：广东省科技厅重点科技攻关项目

在线出版日期：2004-01-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共2页

页码：373-374