分子动力学模拟研究点突变（Met108寅Leu108）对树胶醛糖结合蛋白与配体作用的影响

摘要：

为了研究点突变(Met108→Leu108)对树胶醛糖结合蛋白(ABP)与配体结合能力的影响,对ABP、ABP结合树胶醛糖复合物及ABP结合半乳糖复合物以及它们各自的突变体分别进行60 ns的分子动力学模拟。模拟结果表明,108号残基突变前后,电子等排体的两个氨基酸残基,使蛋白与配体间的范德华相互作用发生明显变化,同时导致蛋白的内部运动也发生变化,进而影响蛋白与配体的相互作用。进一步分析表明,突变前后的蛋白构象变化都趋向于两个结构域张开,而与配体的结合可减缓张开程度。

关键词：树胶醛糖结合蛋白、分子动力学、非极性相互作用

分类号：O641.12+1(物理化学（理论化学）、化学物理学)

资助基金：国家“九七三”计划项目2012CB932800;国家自然科学基金批准号:21173097,21103066资助.@@@@Supported by the for National Basic Research Program of China2012CB932800;the National Natural Science Foundation of China.21173097211,21103066

在线出版日期：2014-02-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：338-343