与甘蔗间作的花生叶片转录组分析

摘要：

为研究间作甘蔗对花生相关基因的表达调控及响应机制,以花生叶片作为材料,使用Illumina NovaSeq 6000高通量测序技术,对间作花生离甘蔗较近的边行(IPA_leaf)、间作花生离甘蔗较远的中间行(IPB_leaf)及单作花生(MP_leaf)叶片进行转录组的测序分析.将各样本获得的转录组数据进行两两比较,MP leaf_ vs_ IPA_leaf、MP_leaf_ vs_ IPB_leaf和IPB_leaf_ vs_ IPA_leaf的差异表达基因数分别是1 806个、968个、1 302个,其中上调表达基因分别占61.13％、48.24％、65.05％.GO功能富集分析显示差异表达基因主要涉及细胞壁组织或生物合成、碳水化合物生物合成与代谢过程、细胞多糖生物合成与代谢过程、细胞葡聚糖生物合成与代谢过程、催化活性、氧化还原酶活性及过程等.KEGG富集分析表明差异表达基因主要涉及的代谢通路有苯丙素类生物合成、α-亚麻酸代谢、淀粉和蔗糖的代谢、类黄酮生物合成等.本研究通过花生叶片转录组分析,为研究间作花生叶片基因的表达调控机制提供基础数据资料.

关键词：花生、间作、转录组、差异表达基因

所属期刊栏目：18

分类号：Q945.78;S153.6;Q75

资助基金：国家重点研发计划;现代农业产业技术体系建设专项;国家自然科学基金;广西自然科学基金;广西农科院基本科研业务费专项;现代农业产业技术体系建设专项;国家自然科学基金;广西自然科学基金;广西农科院基本科研业务费专项

在线出版日期：2020-08-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：4188-4196