茶树金属耐受蛋白基因CsMTP1的克隆及生物信息学分析

摘要：

金属耐受蛋白MTP (Metal tolerance protein)属于重金属转运蛋白家族(CDF),在植物细胞内金属离子平衡调控过程中发挥重要作用.本研究采用RT-PCR及电子克隆的方法获得茶树重金属耐受蛋白基因CsMTP1 (NCBI-Gene ID:114289995),其全长cDNA为1 239 bp,编码412个氨基酸残基,其编码蛋白分子量为45.61 kD,等电点为6.19;在线软件分析表明:CsMTP1蛋白含有6个跨膜结构域和1个CDF保守结构域,属于Zn-CDF亚家族,且蛋白三级结构也与已知植物锌离子转运蛋白相似;系统进化树分析结果表明:茶树CsMTP1与葡萄VvMTP1进化同源性最高,其氨基酸序列相似度高达74.82％;RNA-Seq数据库表达分析结果显示:CsMTP1基因在茶树茎中的表达量最高,其次是根和嫩叶,老叶中的表达量最低;在线软件分析获得CsMTP1蛋白定位于液泡膜.本研究结果推测树CsMTP1蛋白属于Zn-CDF亚家族,可能参与茶树体内锌离子的转运平衡调控过程.

关键词：茶树(Camellia sinensis L.)、CsMTP1、基因克隆、生物信息学分析

所属期刊栏目：17

分类号：TQ9;S51

资助基金：中央高校基本科研业务费专项资金项目XDJK2018C069,XDJK2019D032

在线出版日期：2020-01-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：7350-7356