不同丙型肝炎病毒基因分型检测方法学的比较

摘要：

目的 通过丙型肝炎基因分型检测方法学的比较,为实验室选择提供依据.方法 选取宁夏回族自治区人民医院 2019 年 1 月至 2021 年 12 月丙型肝炎确诊患者血清样本 148 份,使用PCR-荧光探针法、PCR-反向点杂交法及Sanger测序法进行丙型肝炎病毒基因分型检测,并采用卡方检验、Kappa检验对这三种检测方法进行比较分析.结果 PCR-荧光探针法检出136例,检出率91.89%,共检出4种基因型,分别为1b、2+、3+和6+.PCR-反向点杂交法检出135例,检出率为91.22%,共检出5种基因型,分别为1b、2a、3a、3b和6a.Sanger测序法检出148例,检出率100%,共检出7种基因型,分别为1b、2a、3a、3b、6a、1g和6xa.PCR-荧光探针法未检出的12例样本中,Sanger测序法均已检出,其中包括1例6xa型,1例1g型.两种方法的检出率比较差异无统计学意义(χ2=7.565,P＞0.05).两种方法比较一致性较高(κ=0.871,P＜0.001).PCR-反向点杂交法未能测出的13例样本,Sanger测序法均已检出,其中包括1例1g型.PCR-反向点杂交法检出1例3b型,Sanger测序法检出为6xa型.两种方法的检出率比较差异无统计学意义(χ2=8.696,P＞0.05).PCR-反向点杂交法与Sanger测序法一致性高(κ=0.609,P＜0.05).结论 PCR-荧光探针法和PCR-反向点杂交法操作简单,适合临床推广,Sanger测序法准确性高,可对其他方法进行补充,实验室可结合自身情况进行选择.

关键词：丙型肝炎病毒、基因分型检测、方法学比较

所属期刊栏目：15

分类号：R734.2;R331;R446

资助基金：宁夏自然科学基金项目2020AAC03352

在线出版日期：2023-09-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1426-1430