基于TCGA数据库分析DDX27在肝细胞癌中的预后价值

摘要：

目的 基于癌症基因图谱(TCGA)数据库,分析DEAD-BOX RNA解旋酶(DDX27)基因在肝细胞癌中的表达、临床意义以及分子信号通路.方法 通过TCGA数据库下载的肝细胞癌相关的表达数据和临床特征数据,运用R.4.0.3软件和Strawberry Perl 5.32.0.1提取肝癌组织和正常组织中DDX27的表达量数据,使用Mann-Whitney U检验比较两组间的表达差异.以DDX27表达量中位值为界将临床资料分为高表达组和低表达组,采用卡方检验分析表达量与临床特征之间的关系.分别进行单因素和多因素cox回归分析,使用Kaplan-Meier法进行生存分析并采用多种在线数据库验证,利用基因富集分析(GSEA)预测DDX27在肝细胞癌中参与的信号通路.结果 肝细胞癌组织中的DDX27表达量显著高于正常组织,差异有统计学意义(P<0.05),单因素cox回归分析发现DDX27表达与Stage分期(P<0.05)和T分期(P<0.05)有关.多因素cox回归分析得到DDX27(HR=1.07,95％CI:1.02～1.13,P<0.05)可以作为肝细胞癌的独立预后因素.DDX27高表达组的总生存率显著低于低表达组,差异有统计学意义(P<0.05),与多个在线数据库验证结果一致.GSEA结果表明,高表达的DDX27主要参与RNA降解、细胞周期、嘌呤代谢、同源重组、核苷酸切除修复及胞质DNA传感通路等与癌症发生的分子信号通路.结论 DDX27在肝细胞癌患者中高表达,与肝细胞癌的预后相关,可以作为肝细胞癌预后的新型分子标志物.

关键词：DDX27、肝细胞癌、TCGA数据库、GSEA、信号通路

所属期刊栏目：15

分类号：R737.11;R573;R687.3

资助基金：国家自然科学基金;湖北省医学青年后备人才青年拔尖人才HB20200409;湖北省卫生和计划生育委员会联合基金项目;湖北省卫生健康科研基金;武汉市应用基础研究;武汉大学医学部教学研究项目;武汉大学中南医院转化医学;交叉学科研究联合基金资助项目;武汉大学中南医院科技创新培育基金;武汉大学中南医院科技创新培育基金;武汉大学大学生创新项目;武汉大学大学生创新项目

在线出版日期：2023-06-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：549-553