荆州地区HPV-52型E7基因多态性分析和T细胞表位预测

摘要：

目的 研究湖北荆州地区人乳头瘤病毒52型(HPV-52)E7基因变异特征以及预测T细胞表位.方法 扩增HPV-52阳性样本E7基因,测序并与GenBank参考序列比对,分析序列变异性,构建E7基因系统发育树,估算基因选择压力以及预测E7蛋白T细胞表位.结果 HPV-52 E7基因突变序列中检测到19个单核苷酸突变,包括10个非同义突变和9个同义突变.常见的单核苷酸突变为751C>T和801A>G,突变率分别为96.51％和98.84％.3个非同义突变发生在编码E7蛋白β折叠区域内.系统进化分析表明荆州地区HPV-52 E7基因变异序列主要分布在B谱系.对于HLA-A*02:01,MLLGTLQVV(84-92)表位亲和力最强,对于HLA-DQA1*01:01/DQB1*02:01,ATIKDYILDLQPETT(6-20)表位亲和力最强.结论 湖北荆州地区HPV-52 E7基因序列具有多态性,单核苷酸突变的发现以及T细胞表位预测可为HPV治疗性疫苗的研究提供科学依据.

关键词：人乳头瘤病毒52型、E7基因、多态性、T细胞表位

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资助基金：2019年湖北省中央引导地方科技发展专项2019ZYYD066

在线出版日期：2021-03-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：211-215