基于TCGA数据库分析PFKFB4在肝细胞癌的临床意义及分子机制

摘要：

目的 研究6-磷酸果糖-2-激酶/果糖-2,6-二磷酸酶4(PFKFB4)在肝细胞肝癌(LIHC)中表达和甲基化与预后的关系,分析PFKFB4在LIHC恶性进展中的作用机制.方法 从TCGA数据库下载LIHC的RNA-seq数据和临床信息,分析比较PFKFB4在LIHC样本和正常样本中的表达差异,利用卡方检验分析PFKFB4与患者临床特征的关系.通过Kaplan-Meier法和Cox风险回归分析PFKFB4在LIHC中的预后价值.利用基因富集分析(GSEA)探索PFKFB4参与的分子通路,并通过MethSurv和TCGA Wanderer等在线数据库分析PFKFB4与LIHC发展有关的甲基化位点.结果 PFKFB4在LIHC样本中的表达水平显著上调,差异有统计学意义(P＜0.05),其表达与患者的Stage分期呈显著负相关(P＜0.05),PFKFB4高表达组的患者总体生存率(OS)比低表达组更差(P＜0.05),可作为LIHC的独立预后因子(HR=1.908,95％CI:1.332～2.733,P＜0.05).GSEA分析结果提示,PFKFB4可能参与糖酵解、细胞自噬和P53等信号通路,并通过PFKFB4的去甲基化调控PFKFB4的表达,影响预后.结论 PFKFB4的低甲基化水平使PFKFB4在LIHC中显著上调,可通过多条分子通路调控LIHC的发生发展,是LIHC的独立预后因子.

关键词：肝细胞癌、PFKFB4、TCGA、GSEA、甲基化

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资助基金：国家自然科学基金;湖北省卫生健康科研基金资助;武汉市应用基础研究;湖北省卫生和计划生育委员会联合基金项目;湖北省卫生和计划生育委员会青年人才项目;武汉大学中南医院科技创新培育基金;武汉大学大学生创新项目

在线出版日期：2021-03-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：25-29