曼氏迭宫绦虫cathepsin L样蛋白酶的生物信息学分析
目的 通过生物信息学预测曼氏迭宫绦虫cathepsin L样蛋白酶(Smcathepsin L样蛋白酶)的生物学特征及其潜在功能和结构,为下一步Smcathepsin L样蛋白酶参与寄生虫和宿主相互作用过程研究提供依据. 方法 通过NCBI的ORF finder工具对Smcathepsin L样蛋白酶的开放阅读框(ORF)进行分析,利用ExPASy网站进行蛋白的物理化学参数、信号肽、跨膜螺旋和潜在分子生物学功能的预测,通过NCBI/BLAST对蛋白保守功能域进行预测.从NCBI网站获取不同物种的cathepsinL样蛋白酶序列,并利用Vector NTI suit 8.0和TreeView软件进行分析.利用SWISS-MODEL网站和SPDBV4.10软件分析Smcathepsin L样蛋白酶的三维空间结构. 结果 Smcathepsin L样蛋白酶是一个全长基因,编码336个氨基酸.蛋白由2个典型的cathepsin L样蛋白酶结构域组成,序列当中有信号肽,是一个稳定的可溶性蛋白分子.三维空间立体结构分析结果显示Smcathepsin L样蛋白酶是一个保守的蛋白.Smcathepsin L样蛋白酶编码氨基酸序列与细粒棘球绦虫、链状带绦虫、多房棘球绦虫和人的cathepsin L样蛋白酶基因的同源性分别是50％、50％、49％和46％.分子进化分析显示SmcathepsinL样蛋白酶与日本血吸虫、多房棘球绦虫和链状带绦虫亲源性更近,而与其他物种,例如原虫、线虫和哺乳动物亲源性较远. 结论 Smcathepsin L样蛋白酶可能是一个潜在的分泌蛋白,该蛋白能在胞外发挥作用,即在寄生虫的消化、转移、入侵及宿主-寄生虫相互作用中起着重要的作用,是一个具有潜在研究价值的多功能分子.
曼氏迭宫绦虫、cathepsin L样蛋白酶、生物信息学分析
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R38;R53
国家自然科学基金课题81560332,81660345;海南省自然科学基金课题814298;海南医学院2016年引进人才科研启动经费2016011;海南医学院大学生创新创业训练计划项目HYCX2016029
2017-09-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）
共6页
328-333
