一种初步快速甄别总肠道病毒的基因分型方法

摘要：

目的 建立并验证总肠道病毒5’-非编码区(5＇-non coding region,5＇-NCR)PCR扩增测序并在NCBI数据库比对进行生物信息分析的方法,为手足口病的早期快速诊断提供敏感、高效的总肠道病毒分子分型检测方法. 方法 收集165例临床检测阳性的标本,提取总RNA扩增人肠道病毒A、B、C和D型5＇端非编码区用于总肠道病毒初步基因分型,PCR产物测序并在Genbank中进行BLAST分析.结果 成功从临床咽拭子标本中扩增了5＇-NCR用于基因分型.165例总肠道病毒阳性标本中鉴定出12种肠道病毒类型,有77例人肠道病毒(enterovirus type 71,EV-71),37例人柯萨奇病毒(coxsackievirus,CV)CV-A16,31例CV-A4,20例其它型别. 结论 5＇-NCR PCR测序是总肠道病毒基因分型和监测的敏感、简单、早期、快速的检测方法.

关键词：手足口病、肠道病毒、分子流行病学、分子分型

所属期刊栏目：8

分类号：X50;R51

资助基金：广东省自然科学基金S2012010009538,2016A030313501;广州市妇女儿童医疗中心博士启动基金2008031

在线出版日期：2016-08-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：231-236,264