拟南芥psrp-3基因的PCR扩增与生物信息学分析

摘要：

采用PCR法获得拟南芥叶绿体核糖体psrp-3基因序列并进行生物信息学分析.根据psrp-3基因序列保守区设计2对引物,通过RT-PCR获得预期大小的基因序列,琼脂糖凝胶电泳鉴定目的片段.利用生物信息学软件对拟南芥psrp-3基因序列进行同源比对、氨基酸组成、功能域、二级结构、疏水性、蛋白质功能及系统进化分析和预测.结果表明,RT-PCR获得了一段753 bp的序列,psrp-3蛋白是等电点为9.27的亲水性稳定蛋白,包含一个结构域和一个区域,a螺旋和不规则卷曲是其蛋白质二级结构的主要结构元件,β折叠和伸展链散布其中,和菠菜、葡萄、蓖麻、大豆等的psrp-3蛋白有较高的同源性.为进一步了解psrp-3基因的功能和作用机制打下基础.

关键词：拟南芥、叶绿体、psrp-3基因

所属期刊栏目：26

分类号：O657(分析化学)

资助基金：国家自然科学基金资助项目40806047;大连市青年基金资助项目2006J23JH036;辽宁省水生生物学重点实验室资助项目KLHB-06-12;南京中医药大学青年基金资助项目07XZR11;江苏省中管局资助项目LB09017

在线出版日期：2010-12-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：80-85