Λ-、Δ-[Rh(bpy)2chrysi]3+对含C:T错配的DNA序列识别作用的分子模拟研究

摘要：

通过分子模拟方法研究了手性金属配合物[Rh (bpy)2Chrysi]3+ ( bpy=2,2'-bipyridine; Chrysi= 5,6- chrysenequinonediimine )对包含C:T 错配碱基对的B-DNA序列的识别作用.结合类似的针对含G:A错配的和正常的B-DNA序列的识别作用研究,发现配合物[Rh (bpy)2Chrysi]3+可以对错配B-DNA序列进行序列特异性的识别.能量对比计算结果表明,该经典插入识别作用倾向于在错配碱基对附近进行,其中Δ - [Rh(bpy)2chrysi]3+比其手性异构体更占优势.这同Barton教授工作组的实验结果是一致的.另外插入作用倾向于在错配序列中的正常双碱基对C3A4/G3T4(错配碱基对附近)中从小沟进行.与该配合物对含G:A错配的和正常的B-DNA序列的识别作用不同的是,对包含C:T 错配碱基对的B-DNA序列的识别作用倾向于从小沟进行.这一点可能源于C:T碱基对结构的不同.

关键词：分子模拟、ESFF、C:T错配DNA、金属配合物

所属期刊栏目：22

分类号：Q52(核酸)

资助基金：国家自然科学基金30470408;山西省青年基金20041032

在线出版日期：2006-07-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：175-181