应用ABEEM/MM蛋白质力场模型研究半胱氨酸二肽构象的性质

摘要：

ABEEM/MM蛋白质力场模型是应用于蛋白质体系的原子-键电负性均衡方法(ABEEM)与力场(MM)相结合的浮动电荷模型.该模型能够准确地描述分子在环境变化时的静电极化,并能快速计算气态和溶液多肽的结构和能量.首次应用ABEEM/MM蛋白质力场模型研究半胱氨酸二肽构象的性质,如构象能、氢键等.此外,应用从头计算HF/6-31G··方法对其性质进行计算.ABEEM/MM蛋白质力场模型可以快速准确地得到半胱氨酸二肽分子不同稳定构象的性质,其结果可以和从头计算相媲美.以上研究有助于加深对半胱氨酸二肽构象性质的了解,从而也为进一步验证ABEEM/MM蛋白质力场模型的正确性以及参数的合理性提供可靠的依据.

关键词：ABEEM/MM蛋白质力场模型、浮动电荷、半胱氨酸二肽构象

所属期刊栏目：22

分类号：O641(物理化学（理论化学）、化学物理学)

资助基金：中国科学院资助项目20373021

在线出版日期：2006-05-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：89-95