基于16S rRNA高通量测序技术的肠道菌群多样性推断死亡时间

摘要：

目的 采用16S rRNA高通量测序技术探究大鼠肠道菌群变化与死亡时间(postmortem interval,PMI)之间的关系.方法 大鼠腹腔麻醉致死后置于16℃,提取死后0、1、2、3、5、7、9、12、15、18、21、24、27和30 d共14个时间点的盲肠内容物DNA,采用16S rRNA高通量测序技术,检测大鼠盲肠内容物中的肠道菌群,对数据进行多样性及差异性分析.结果 死后30 d内大鼠肠道微生物菌群总数未发生明显变化,但菌群多样性呈上升趋势.在死后13个时间点共筛选出119个具有显著差异的细菌群落.构建全部时间点、9 d前、12 d后PMI推断的偏最小二乘(partial least squares,PLS)回归模型,其决定系数(R2)分别为0.795、0.767和0.445;交叉验证均方根误差分别为6.57、1.96和5.37 d.结论 利用16S rRNA高通量测序技术探究死后30 d内肠道菌群的变化规律,其组成和结构出现了明显的变化,且建立的PLS回归模型表明PMI与肠道菌群之间高度相关，呈一定时序性变化.

关键词：法医病理学;16S rRNA;死亡时间推断;肠道菌群;高通量测序;大鼠

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分类号：DF795.1(诉讼法)

资助基金：国家自然科学基金面上资助项目;山西省应用基础研究青年科技资助项目

在线出版日期：2022-01-06（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：621-626